В учении Сен-Симона Анфантена привлекали экономическая сторона и идея «нового христианства». После смерти Сен-Симона Анфантен вместе с Базаром возглавил сен-симонистскую школу, которая постепенно превратилась в церковь, одним из первосвященников которой стал Анфантен. После развала сен-симонистской «семьи» в 1831 году, Анфантен создал в Менильмонтане близ Парижа трудовую общину, где пытался воплотить в жизнь идеи коллективного труда и свободной любви.
В 1832 году власти подвергли членов общины судебному преследованию. Анфантен отбыл год в тюрьме «за оскорбление нравственности». Позднее он участвовал в инженерных работах в Египте, одним из первых выдвинул проект строительства Суэцкого канала. Анфантен приветствовал приход к власти Наполеона III Бонапарта.