Выпускник варшавской Главной школы планирования и статистики (1970), доктор экономических наук (1990). В 1972-74 обучался в университете Нью-Йорка. В 1978-81 руководитель группы независимых ученых, занятых разработкой альтернативного проекта экономической реформы в Польше. Создатель теории «шоковой терапии» — радикальной трансформации «социалистической системы хозяйствования» в рыночную экономику.
С 1981 связан с движением профобъединения «Солидарность».
В 1989 назначен заместителем председателя Совета министров, министром финансов ПНР, председателем Экономического комитета Совета министров. Последовательная реализация «шоковой терапии» в Польше позволила без больших социальных издержек и потрясений перейти к рыночным формам хозяйствования. С октября 1997 заместитель председателя Совета министров Польши и министр финансов. Выражая несогласие с экономической политикой правительства Бузека, в мае 2000 подал в отставку.
Однако Президент Александр Квасьневский вскоре назначил его председателем Национального банка, и Сейм утвердил его кандидатуру голосами «Солидарности» и «Союза свободы». Он был Председателем Национального банка Польши с 10 января 2001 года по 10 января 2007 года. В связи с назначением Бальцерович покинул пост Председателя партии «Союз свободы». В 2000—2002 годах Бальцерович был также советником Президента Грузии Эдуарда Шеварднадзе по экономическим вопросам.
В 2003 году в Цюрихе Лешек Бальцерович был избран членом престижной Группы авторитетов Международного института финансов.
11 ноября 2005 года Президент Польши Александр Квасьневский вручил Бальцеровичу высшую награду страны — Орден Белого орла.
В июле 2007 года аналитический центр European enterpris institute (Брюссель) присвоил Бальцеровичу титул «самого крупного реформатора в странах Евросоюза»
В октябре 2008 года Лешек Бальцерович стал одним из 8 членов Европейской экспертной группы по разработке рекомендаций по предотвращению последствий мирового финансового кризиса в странах Евросоюза во главе с председателем МВФ Жаком де Ларозьером.