Мишель де Нострдам родился 14 декабря (по некоторым данным, 21 декабря), 1503, в Сен-Реми-де-Прованс к югу от Франции в семье нотариуса. Он был одним из девяти детей своих родителей. Его дед по отцовской линии Ги Гассоне, обратившийся из иудаизма в католицизм примерно в 1460 году, взял фамилию Нострдам в честь святого, в день которого произошло преобразование. Мать Мишеля была внучкой Пьера де Сен-Мари, известного врача. Согласно некоторым источникам, в детстве будущего прорицателя обучал его прапрадед по материнской линии Жан де Сент-Реми. Его дедушке также приписывают преподавание классических языков и математики. Когда Мишелю было 15 лет, он поступил в Авиньонский университет для изучения медицины и получения степени бакалавра. Однако, после вспышки чумы, университет был закрыт, и он был вынужден уехать и прекратить занятия.
В 1521 году Нострадамус совершил восьмилетнее путешествие по сельской местности и практиковал в качестве аптекаря в течение нескольких лет. Позже он поступил в Университет Монпелье в 1529 году, но увлечение астрологией не понравилось католическими священниками и его исключили. В последующие годы этот врач продолжал лечить жертв чумы, путешествуя по всей Франции и Италии. Он экспериментировал с новыми средствами, вылечил внушительное число пациентов, улучшив их гигиену и диету.
После переезда в Ажен в 1531 году Нострадамус женился на местной жительнице, которую звали Генриетта дʼЭнкосс, у них родилось двое детей. По иронии судьбы, репутация Нострадамуса как врача пострадала после того, как он не смог спасти жену и детей, которые умерли в 1534 году, предположительно, от чумы. В 1547 году он женился на богатой вдове по имени Анна Понсард, с которой у него было шесть детей: трое сыновей и три дочери. Нострадамус долгое время страдал подагрой. В 1566 году у него возник большой отек из-за аномального количества жидкости, которая накапливались под кожей. В июне этого же года он вызвал своего нотариуса, чтобы создать завещание, оставляя большую часть своего имущества жене и детям. В некоторых записях утверждается, что Нострадамус якобы предсказал свою смерть, поскольку он объявил своему секретарю вечером 1 июля, что на следующее утро его не найдут живым. На следующий день он и был найден мертвым (2 июля 1566 года), после чего его похоронили в местной францисканской часовне в Салон-де-Прованс.