Композитор появился на свет в Кадельяно-Виконаго в Италии у богатых родителей. Он был шестым ребенком Альфонсо и Инес Менотти. Его отец работал торговцем кофе, а мать была одаренным музыкантом и часто устраивала небольшие музыкальные концерты на своей семейной вилле. Маленький вундеркинд Джанкарло начал изучать музыку довольно рано, и к 11 годам уже написал две оперы, в том числе «Смерть Пьеро» и «Русалочка». Юноша поступил в Миланскую консерваторию в возрасте 14 лет. К 17 он переехал в США со своей матерью. Один из друзей его семьи, Артуро Тосканини, помог ему поступить в Кертисовский институт музыки в Филадельфии. Там он изучал композицию вместе с Росарио Скалеро и встретил своего возлюбленного композитора Сэмюэла Барбера, с которым провел более 40 лет своей жизни. Будучи студентом, Менотти проводил время с семьей Барбера в Уэстчестере, штат Пенсильвания.
После окончания института в 1933 году начал работать над своей первой зрелой оперой «Амелия аль Балло». Ее премьера состоялась в 1937 году и была воспринята с большим энтузиазмом. Фактически, Джанкарло получил такие лавры, что руководители Метрополитен-опера взяли его на следующий год. Единственным провалом ранней карьеры Менотти был «Остров Бога» (1942) по заказу Метрополитен-опера. В годы войны он написал «Концерт для фортепиано с оркестром» и балет «Себастьян». Его камерная опера «Медиум» была впервые показана в мае 1946 года. В следующем сезоне на Бродвее было поставлено 212 спектаклей в сочетании с одноактной комедией «Телефон». «Консул» (1950), первая полнометражная опера композитора, которую многие считают шедевром, получила Пулитцеровскую премию. История, вдохновленная тяжелым положением людей, попавших в европейские тоталитарные государства после Второй мировой войны, изначально предназначалась для голливудского фильма. «Амал и ночные гости», рождественская классика, появилась в 1951 году. Эта заветная опера автора отпраздновала золотой юбилей своей премьеры в 2001 году и до сих пор продолжает радовать сотнями спектаклей каждый год. В 1958 году Менотти основал Фестиваль двух миров в Сполето, Италия, и аналогичный фестиваль в 1977 году в Чарльстоне, штат Южная Каролина. Основной целью этих фестивалей было донести оперу до зрителей, которые в ней заинтересованы. Это также помогло многим артистам сделать карьеру, благодаря чему Ширли Верретт успешно зарекомендовала себя как певица, а Пол Тейлор и Твайла Тарп — как хореографы.
Джанкарло Менотти скончался в возрасте 95 лет 1 февраля 2007 года в больнице в Монте-Карло, Монако. Он получил несколько наград, включая стипендию Гуггенхайма (1946-47), Пулитцеровскую премию в области музыки и нью-йоркскую премию драматических критиков (1950). Композитор был удостоен Пулитцеровской премии за оперу «Святая с Бликер-стрит» (1955). В 1984 году получил премию центра Кеннеди за достижения в искусстве, а в 1991 году был удостоен звания «Музыкант года».